臭氧水体消毒：由于臭氧在水中的不稳定性，分解后产生氧化能力极强（比单原子氧还强）的羟基（OH）和单原子氧等，可有效的杀灭水中的各种细菌和病毒。国外把臭氧视作最为理想的水质消毒净化剂，很多大型水厂普遍采用臭氧来处理饮用水，我国的昆明自来水公司，深水集团、上海自来水公司也陆续采用臭氧对水质进行净化消毒。

       氯剂消毒水，可以产生致癌毒物三氯甲烷，如果氯剂投加量增多，三氯甲烷的生成量也就增多，随着人类对致癌物质毒性的研究深入，世界水质协会，世界卫生组织等已经不主张将氯剂用于饮水消毒。而臭氧用于饮水消毒有以下优点：氧化能力强，杀菌效率高，杀菌速度快，臭氧杀灭水中微生物的效率是氯剂的600－3000倍，可以杀灭水中所有的细菌、病毒、芽胞、孢子虫类，还能杀灭藻类等；臭氧在水中的作用后，产物是无毒无害的氧气，并且臭氧本身无永久的残留性，还能增加水中溶解氧；有去色、除臭的作用，降低水的浑浊度；能氧化分解水中的铁、锰、银、钴、悬浮颗粒、有机农药和洗涤剂等，极大改善水质。

       水处理中臭氧的投加量要根据水的理化性质、污染程度、接触时间等设计。对于生活用水和饮用水消毒时，投加0.1－1mg/L即可，一般水体投加臭氧量0.5-1.5mg/L，接触5－10分钟，水中保持剩余臭氧浓度0.1-0.5mg/L。臭氧也广泛用于污水处理，由于臭氧的强杀菌能力，国外许多医院采用臭氧处理污水，并取得了满意的效果，试验证明，当医院排放污水中含有106—108个细菌/L时，投加臭氧浓度达10－20mg/L作用10－15分钟，对细菌繁殖体的杀灭率达99.999％－100％，投加25－30mg/L作用15分钟，对芽胞的杀灭率也可达99.999％以上。臭氧用于饮用水、污水消毒的同时，还可以制成高浓度臭氧消毒水，对蔬菜、瓜果、食品用具、手和其他物品清洗、消毒。在日本，使用高浓度臭氧消毒水已经成为消毒领域的重点，特别是，在1996年夏季，病原型大肠杆菌0517爆发性感染事件中，以前使用的次氯酸钠、乙醇、乙酸等杀菌剂，在长期的100－300ppm浓度下，致使大肠菌等革兰氏阴性菌产生极强的抗药菌变异，而作用机理完全不同的高浓度臭氧消毒水对此却十分有效。而在日本的医疗卫生系统，抗青霉素金黄色葡萄球菌感染也成为严重的问题，使用高浓度臭氧水进行医疗人员洗手以及医疗器械消毒的解决办法受到了重视。日本在进行臭氧水对医疗部门相关微生物的杀菌效果试验中，对在平时经常性接触的，也是在医院感染中重要的微生物作为测试样本，如细菌：大肠杆菌IFO3301、铜绿色极毛杆菌IFO3445、金黄色葡萄球菌ATCC43300、表皮葡萄球菌IFO12993；病毒：疱疹病毒RF、腺病毒3型、科赛奇病毒B5FAULKNER、艾珂病毒7型WALLACE、流行感冒病毒PR8等，与氯剂消毒水对比，各供试菌在臭氧水浓度4mg/L作用10秒后即可全部杀死，而对照组在30秒后，仍有103mg/L以上的活菌数残存。对于病毒，其结果由病毒半数组织培养感染量（TCID50）表示，TCID50减少103以上，可认为病毒灭活。         在臭氧水4mg/L浓度作用下20秒，疱疹病毒、流行感冒病毒减少TCID50103以上，科赛奇B5病毒、艾珂7型病毒减少TCID50104以上，所以可以确认臭氧水对于医疗、制药及食品加工领域中引起感染的细菌、病毒具有很好的杀灭作用。 

        在对医护人员清洗手指附着菌去除，供试菌体为抗青霉素金黄色葡萄球菌，对比组采用消毒用乙醇，MK212。对清洗后排水鉴定杀菌效果和排水二次污染，排水中菌数，对照组104，臭氧水仅为101。证明臭氧水杀菌效果明显，而且对外界没有造成二次细菌污染。对禽流感也能起到有效的预防作用。